Koniec uproszczeń-wewnątrzwspólnotowe nabycie i dostawa zostaną zastąpione przez procedury importu oraz eksportu

Nie będą także dostępne pewne procedury uproszczone w rozliczeniach VAT, takie jak na przykład rozliczanie transakcji trójstronnych, co może skutkować koniecznością rejestracji na VAT w innych krajach lub zmianami w łańcuchach dostaw. Również procedury w zakresie wnioskowania o zwrot zagranicznego VAT będą inne niż dotychczas stosowane w ramach UE. Dodatkowo brexit wpłynie na opodatkowanie usług, w tym transportu czy turystyki. Przygotowując się do brexitu, firmy handlujące z Wielką Brytanią, w szczególności w ramach łańcucha dostaw, będą musiały przeanalizować zawierane transakcje i na nowo określić ich konsekwencje w VAT. W niektórych przypadkach może okazać się niezbędna rejestracja na VAT w innym kraju, a co za tym idzie – pojawią się dodatkowe koszty administracyjne.