Organy podatkowe oceniają tę samą transakcję w różny sposób

Organy skarbowe w trakcie kontroli podatkowych odmawiają przyjęcia stanowiska, które wcześniej zostało potwierdzone w interpretacji podatkowych dla drugiej strony transakcji.
 

Zagadnienie to może być w szczególności problematyczne w zakresie skutków podatkowych w podatku od towarów i usług. Z istoty VAT wynika natomiast, że dana transakcja rozpoznana przez jedną stronę transakcji powinna być lustrzanym odbiciem transakcji u tej drugiej.
 

Sprzedawca może wystąpić o interpretację indywidualną i uzyskać potwierdzenie co do sposobu określenia podstawy opodatkowania. Na tej podstawie sprzedawca wystawi fakturę i obliczy podatek VAT, który u kupującego stanowić powinien, co do zasady, podatek naliczony. Jeśli jednak kupujący nie wystąpi o własną interpretację, dojdzie do sytuacji, gdzie tylko jedna strona transakcji będzie chroniona przed ewentualnymi negatywnymi skutkami przyjęcia przez organy podatkowe odmiennej wykładni w zakresie sposobu określenia podstawy opodatkowania dla tej transakcji. W konsekwencji, jeśli taka transakcja zostanie zbadana przez organy podatkowe i skarbówka uzna, że rozliczenie dokonane zgodnie z interpretacją było błędne, mogą zakwestionować rozliczenie podatkowe, ale tylko tej strony, która nie uzyskała interpretacji, czyli kupującego.

Oznacza to, że wartość podstawy opodatkowania u stron tej samej transakcji będzie inna tj. wyższa u sprzedającego który rozlicza podatek należny, natomiast niższa u kupującego, który rozlicza podatek naliczony.